La Universidad Nacional Autónoma de México y Oxford Population Health se asocian con DNAnexus y AWS para optimizar el acceso a los datos del Estudio Prospectivo de la Ciudad de México

1ro de Mayo del 2023

Una nueva Plataforma de Análisis de Investigación permitirá a investigadores en México acceder a los datos genéticos del Estudio Prospectivo de la Ciudad de México, gracias a una colaboración entre la Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), Oxford Population Health, DNAnexus y Amazon Web Services (AWS).

El Estudio Prospectivo de la Ciudad de México es una colaboración entre la UNAM y Oxford Population Health. Incluye datos de más de 150,000 adultos mexicanos que fueron reclutados originalmente entre 1998 y 2004. Los participantes del estudio proporcionaron información sobre su estilo de vida e historial de enfermedades, registraron medidas físicas y proporcionaron muestras de sangre.

Al vincular a los participantes con el registro nacional de mortalidad de las últimas dos décadas, los investigadores pueden estudiar cómo los factores sociales, de estilo de vida, físicos, metabólicos y genéticos influyen en las principales causas de muerte en adultos mexicanos. Los principales hallazgos anteriores del estudio incluyen un efecto de la diabetes sobre la muerte prematura mucho mayor de lo esperado y el descubrimiento de mutaciones genéticas raras que están asociadas con protección contra la obesidad.

El Estudio Prospectivo de la Ciudad de México tiene datos genéticos que son demasiado grandes para ser compartidos por medios directos y requieren una enorme capacidad computacional para ser analizados. La plataforma de análisis computacionales en la nube, desarrollada por DNAnexus en la nube de AWS, se basa en la arquitectura del sistema que utiliza UK Biobank. Esta plataforma computacional en la nube, de gran capacidad y alta seguridad, permitirá a los investigadores realizar análisis que acelerarán tanto la velocidad como la escala de sus proyectos de investigación relacionados con la salud.

Usando esta plataforma, los investigadores en México tendrán acceso a un ambiente que reúne datos, herramientas analíticas, e infraestructura, en un sistema único. También tendrán acceso exclusivo a los datos durante un período de al menos 12 meses antes de que los investigadores de otros países puedan presentar solicitudes de acceso.

Jesús Alegre-Díaz, Profesor de Epidemiología de la UNAM e Investigador Principal en México del Estudio Prospectivo Ciudad de México comenta: “Nuestro trabajo con Oxford Population Health, DNAnexus y AWS representa una oportunidad única para que investigadores en México usen los datos de los mexicanos que participaron en el estudio antes que otros investigadores en el resto del mundo. El acceso a los datos genéticos recopilados por el Estudio Prospectivo de la Ciudad de México impulsará la investigación médica en México y ayudará a resolver algunos de los desafíos de salud más apremiantes que enfrenta el mundo en la actualidad.”

Jonathan Emberson, Profesor de Estadística Médica y Epidemiología en Oxford Population Health e Investigador Principal en el Reino Unido para el Estudio Prospectivo de la Ciudad de México, dijo: "El Estudio Prospectivo de la Ciudad de México es un recurso invaluable para mejorar nuestra comprensión de cómo distintas enfermedades afectan a diferentes poblaciones y para apoyar el desarrollo de políticas públicas en salud que podrían beneficiar a una gama más amplia de personas. Junto con nuestros colaboradores mexicanos en la UNAM, estamos entusiasmados de trabajar con DNAnexus y AWS para asegurarnos que esta información sea más accesible y sostenible para más investigadores.

Richard Daly, director ejecutivo de DNAnexus dijo: “Nos sentimos honrados de ser parte de esta emocionante colaboración con la Universidad Nacional Autónoma de México, Oxford Population Health y AWS. Nuestra plataforma de análisis de investigación, basada en el sistema utilizado por UK Biobank, acelerará el ritmo y la escala de la investigación médica al permitir que investigadores analicen los datos genéticos de manera más eficiente y segura en la nube. Esta colaboración tiene el potencial de impulsar la investigación médica en México y de contribuir a abordar los desafíos de salud global de manera significativa.”

John Davies, Director y Gerente General del área de Sector Público en AWS, América Latina, Canadá y el Caribe, dijo: “La cantidad de información que maneja la industria de la salud es astronómica. Estamos encantados de apoyar al Estudio Prospectivo de la Ciudad de México y ayudar a los investigadores a analizar los datos disponibles con los servicios de AWS. Además de ser sostenible y eficiente, la nube tiene el poder de impulsar la innovación. Estamos entusiasmados de ver cómo este proyecto puede conducir a nuevos descubrimientos que potencialmente impacten en la vida de los ciudadanos”.

Los investigadores en México ya pueden solicitar acceso a los datos genéticos del Estudio Prospectivo de la Ciudad de México en la plataforma DNAnexus. Para más información sobre cómo obtener acceso a datos del Estudio Prospectivo de la Ciudad de México, visite el sitio web.

Universidad Nacional Autónoma de México and Oxford Population Health team up with DNAnexus and AWS to improve access to Mexico City Prospective Study data

A new Research Analysis Platform will enable researchers based in Mexico to access genetic data from the Mexico City Prospective Study, thanks to a collaboration between Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), Oxford Population Health, DNAnexus, and Amazon Web Services (AWS).

The Mexico City Prospective Study is a collaboration between Universidad Nacional Autónoma de México and Oxford Population Health. It includes data from over 150,000 Mexican adults who were originally recruited between 1998 and 2004. The study participants provided information about their lifestyles and disease history, had physical measurements recorded, and provided blood samples.

By linking the participants to national mortality records over the past two decades, researchers can now study how social, lifestyle, physical, metabolic, and genetic factors influence the major causes of death in Mexican adults. Previous major findings from the study include the much larger than expected effect of diabetes on premature death and the discovery of rare genetic mutations that are associated with protection against obesity.

The Mexico City Prospective Study encompasses genetic data that is too large to share by direct means and requires an enormous amount of computing capacity to analyse. The cloud-based informatics analysis platform, built by DNAnexus on the AWS cloud, is based on a similar architecture already used by UK Biobank. This powerful and secure cloud computing platform enables researchers to conduct analyses on the data in order to accelerate both the speed and scale of health-related research.

Using this platform, researchers in Mexico will have access to an environment that brings together data, analytical tools, and infrastructure, all in one solution. They will also have exclusive access to the data for a period of at least 12 months before researchers in other countries can submit requests for access.

Professor Jesús Alegre-Díaz, Professor of Epidemiology at UNAM and Study Principal Investigator for the Mexico City Prospective Study said, ‘Our work with Oxford Population Health, DNAnexus, and AWS presents a unique opportunity for researchers in Mexico to explore data from Mexican people ahead of the rest of the world. Improved access to the genetic data collected by the Mexico City Prospective Study will both advance medical research in Mexico and help to solve some of the most pressing health challenges faced by the world today.’

Professor Jonathan Emberson, Professor of Medical Statistics and Epidemiology at Oxford Population Health and UK Principal Investigator for the Mexico City Prospective Study, said ‘The Mexico City Prospective Study is an invaluable resource for improving our understanding of how disease affects different populations and supporting the development of healthcare policies and treatments that could benefit a wider range of people. Together with our Mexican partners at UNAM, we are excited to work with DNAnexus and AWS to make this rich and vital information more accessible and cost effective for a broader range of researchers.’

Richard Daly, CEO of DNAnexus, said ‘We are honoured to be part of this exciting collaboration with Universidad Nacional Autónoma de México, Oxford Population Health, and AWS. Our platform will accelerate the pace and scale of medical research by enabling researchers to analyse genetic data more efficiently and securely in the cloud. This partnership has the potential to advance medical research in Mexico and contribute to addressing global health challenges in a meaningful way.’

John Davies, Director and General Manager, AWS Public Sector, Latin America, Canada, and the Caribbean, said, ‘The amount of information that the health industry manages is astronomical. We are thrilled to support the Mexico City Prospective Study and help researchers explore the data available using AWS services. In addition to being cost effective and efficient, the cloud has the power to drive innovation. We are excited to see how this can lead to new discoveries that potentially impact the lives of citizens.’

Researchers in Mexico are able to apply for access to the Mexico City Prospective Study genetic data on the DNAnexus platform now. To find out more about accessing any data from the Mexico City Prospective Study, visit the study webpages.